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林蠡:龜類(lèi)是新冠狀病毒潛在中間宿主?文章依據(jù)嚴(yán)重不足!

2020-3-1 10:27| 發(fā)布者: 緣木魚(yú)| 查看: 51728| 評(píng)論: 0|來(lái)自: 水產(chǎn)前沿

摘要: 中國(guó)水產(chǎn)頻道原創(chuàng)報(bào)道,其實(shí)至今為止,全世界在龜鱉類(lèi)還沒(méi)有冠狀病毒報(bào)道的先例。龜鱉類(lèi)不是新型冠狀病毒的中間宿主,劉龍和吳建國(guó)團(tuán)隊(duì)的文章結(jié)論依據(jù)不足而且是草率和不負(fù)責(zé)任的。
  文/ 仲愷農(nóng)業(yè)工程學(xué)院動(dòng)物科技學(xué)院院長(zhǎng)、廣東省水產(chǎn)疫病監(jiān)測(cè)與綜合防控共性關(guān)鍵技術(shù)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)首席科學(xué)家、廣東省水生動(dòng)物衛(wèi)生協(xié)會(huì)會(huì)長(zhǎng) 林蠡

仲愷農(nóng)業(yè)工程學(xué)院動(dòng)物科技學(xué)院院長(zhǎng)、廣東省水產(chǎn)疫病監(jiān)測(cè)與綜合防控共性關(guān)鍵技術(shù)創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)首席科學(xué)家、廣東省水生動(dòng)物衛(wèi)生協(xié)會(huì)會(huì)長(zhǎng) 林蠡

  中國(guó)水產(chǎn)頻道原創(chuàng)報(bào)道,2020年2月26日,湖北醫(yī)藥學(xué)院(Hubei University of Medicine)劉龍課題組聯(lián)合暨南大學(xué)(Jinan University)吳建國(guó)課題組(他們兩人是共同通訊作者)在 J Med Virol《醫(yī)學(xué)病毒學(xué)雜志》上發(fā)表論文“Composition and divergence of coronavirus spike proteins and host ACE2 receptors predict potential intermediate hosts of SARS-CoV-2” 中文翻譯是:【冠狀病毒刺突蛋白和宿主血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2(ACE2)受體的組成和分化預(yù)測(cè)新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)潛在的中間宿主】。

網(wǎng)絡(luò)上文章信息截圖如下:
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圖1、網(wǎng)絡(luò)上文章信息截圖

下面我剖析一下這篇文章的主要結(jié)果:
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  在摘要(Abstract)沒(méi)有畫(huà)紅線(xiàn)部分主要是講述研究背景和意義。紅線(xiàn)部分是主要結(jié)果。紅線(xiàn)部分翻譯如下:在這個(gè)研究,我們系統(tǒng)地比較冠狀病毒刺突蛋白和宿主受體血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2(ACE2)結(jié)合的結(jié)構(gòu)域。刺突蛋白和宿主受體血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2(ACE2)結(jié)合的關(guān)鍵氨基酸表明穿山甲、蛇和龜鱉類(lèi)(西部錦龜、綠海龜、中華鱉)可能是人類(lèi)SARS-CoV-2病毒的中間宿主。

  文章的結(jié)果主要來(lái)自下表的冠狀病毒刺突蛋白和宿主受體血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2(ACE2)結(jié)合的結(jié)構(gòu)域氨基酸比較:
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圖2、不同動(dòng)物ACE2蛋白和新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)結(jié)合結(jié)構(gòu)域的氨基酸序列比對(duì)

  根據(jù)上述結(jié)果,作者的主要描述見(jiàn)下面紅色部分

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  紅色部分中文翻譯如下:在龜鱉類(lèi)(西部錦龜、綠海龜、中華鱉)穿山甲和蝙蝠類(lèi)的這個(gè)結(jié)構(gòu)域和理論上可以感染的物種,比如人類(lèi)、大猩猩和獼猴有5個(gè)以上的差異。小鼠和狗的突變多個(gè)5個(gè)氨基酸,貓和倉(cāng)鼠只是有3個(gè)突變。

  在討論這篇文章結(jié)果之前,我們先討論下穿山甲是否為新型冠狀病毒的中間宿主?根據(jù)目前學(xué)術(shù)界的觀(guān)點(diǎn),穿山甲冠狀病毒的全基因組和新型冠狀病毒的全基因組只有90.3%的相似度,穿山甲不是新型冠狀病毒的中間宿主。

  基于上述主要結(jié)果,可以得出以下幾點(diǎn):

  1. 文章作者只是采用采用生物信息學(xué)工具去分析網(wǎng)絡(luò)下載的序列。結(jié)果只是一種預(yù)測(cè),沒(méi)有必須的實(shí)驗(yàn)結(jié)果支撐。如何解讀生物信息結(jié)果,需要非常謹(jǐn)慎。

  2. 作者沒(méi)有從龜鱉類(lèi)上分離到任何冠狀病毒。其實(shí)至今為止,全世界在龜鱉類(lèi)還沒(méi)有冠狀病毒報(bào)道的先例。就算分離到冠狀病毒,作者還要對(duì)分離到的病毒株進(jìn)行全基因組測(cè)序,在核苷酸序列上和SARS-CoV-2病毒全基因組有非常高度(99%以上)的相似度,才能下現(xiàn)在的結(jié)論。

  3. 病毒感染一個(gè)宿主,其生活史為:附著、入侵、脫殼、轉(zhuǎn)錄、復(fù)制、翻譯、組裝和釋放 8個(gè)關(guān)鍵環(huán)節(jié)。任何一個(gè)環(huán)節(jié)出問(wèn)題都會(huì)導(dǎo)致病毒感染的失敗。冠狀病毒刺突蛋白和宿主受體血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2(ACE2)結(jié)合,只是涉及到病毒的入侵環(huán)節(jié)。而且作者也承認(rèn)龜鱉類(lèi)與人類(lèi)的血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2(ACE2)和冠狀病毒結(jié)合的結(jié)構(gòu)域還存在5個(gè)氨基酸的差異。因此,病毒能否進(jìn)入龜鱉類(lèi)細(xì)胞還是疑問(wèn)。就算進(jìn)入細(xì)胞,還要龜鱉類(lèi)細(xì)胞支撐病毒的脫殼、轉(zhuǎn)錄、復(fù)制、翻譯、組裝和釋放 6個(gè)關(guān)鍵環(huán)節(jié)。此外,病毒復(fù)制需要一定的溫度范圍,龜鱉類(lèi)是變溫動(dòng)物,人類(lèi)是恒溫動(dòng)物。龜鱉類(lèi)很難在人的正常體溫(36攝氏度)下存活。

  4. 文章作者充分利用穿山甲是中間宿主這個(gè)結(jié)果來(lái)支撐他們的預(yù)測(cè)。穿山甲是哺乳動(dòng)物,龜鱉類(lèi)是爬行動(dòng)物。在分類(lèi)上,穿山甲比龜鱉類(lèi)更加接近人類(lèi),現(xiàn)在連穿山甲都不是新型冠狀病毒的中間宿主,龜鱉類(lèi)就更加不可能了。

  綜上所述,可以看出,龜鱉類(lèi)不可能是新型冠狀病毒的中間宿主,湖北醫(yī)藥學(xué)院和暨南大學(xué)團(tuán)隊(duì)的結(jié)論缺乏基本的科學(xué)依據(jù)。

  【關(guān)鍵字】:龜鱉類(lèi)   新型冠狀病毒    水產(chǎn)前沿
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