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人工飼料飼養(yǎng)的對蝦腸道菌群和水體細(xì)菌區(qū)系的研究

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    摘自《熱帶海洋學(xué)報》

    摘要: 對人工飼料飼養(yǎng)的凡納濱對蝦成蝦腸道菌群組成及其水體細(xì)菌區(qū)系組成進(jìn)行了研究。分離純化后的革蘭氏陰性菌鑒定到種的水平。對蝦腸道菌群主要由弧菌、希瓦氏菌屬、嗜氫菌屬、伯克霍爾德氏菌、氣單胞菌、食酸菌和芽孢桿菌組成。水體細(xì)菌區(qū)系主要包括弧菌、希瓦氏菌屬、艾肯菌、無色桿菌和芽孢桿菌。腸道菌群和水體細(xì)菌區(qū)系的優(yōu)勢菌是副溶血弧菌和芽孢桿菌。利用Shannon-Wiener 指數(shù)進(jìn)行多樣性分析,發(fā)現(xiàn)蝦腸道多樣性指數(shù)(H ) 和均勻度( J ) 高于水體細(xì)菌區(qū)系,而豐度( D) 較低。

    關(guān)鍵詞: 蝦腸道菌群; 水體細(xì)菌區(qū)系

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    用微生態(tài)學(xué)方法來防治病害發(fā)生、減少環(huán)境污染、增進(jìn)動物健康是未來水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的熱點。腸道菌群是微生態(tài)學(xué)中的一個重要組成部分。腸道菌群對其他動物包括魚蝦類的生長、存活有重要的生理意義[1] 。本文使用Biolog[2]方法對凡納濱對蝦成蝦腸道細(xì)菌區(qū)系組成及其水體細(xì)菌區(qū)系組成進(jìn)行了研究,目的在于為對蝦腸道菌群研究提供一些基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

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    發(fā)表于 2012-8-30 16:03:35 |只看該作者
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    1 材料與方法
    1.1試驗用蝦及飼養(yǎng)管理
    凡納濱對蝦蝦苗購于中國水產(chǎn)科學(xué)研究院南海水產(chǎn)研究所海南開發(fā)中心,體重為0.827±0.006g。蝦苗置于14 個容積為250L 的水池中養(yǎng)殖,每個水池飼養(yǎng)對蝦25 尾。本試驗為全封閉式循環(huán)養(yǎng)殖系統(tǒng),養(yǎng)殖水體為砂濾循環(huán)人工海水。每天早、中、晚各投喂1 次,飼料為添加了芽孢桿菌制劑的對蝦飼料( 中國水產(chǎn)科學(xué)研究院南海水產(chǎn)研究所生產(chǎn)) 。試驗期間水的鹽度為7-11,溫度為28-31℃。飼喂56d 后對蝦平均體重為7.91±0.75g,成活率為95% ±1%。

    1.2
    腸道細(xì)菌分離和計數(shù)
    蝦苗飼養(yǎng)56d 后隨機在一個水池中取14 尾,蝦表面用75% 酒精消毒,在無菌操作下取出整條腸道,加入事先稱重過的已滅菌的玻璃勻漿器中稱重。加入少量無菌生理鹽水( 0.85% NaCl) 進(jìn)行勻漿,勻漿后定容至1ml。以勻漿后的樣品為原液進(jìn)行10 倍梯度稀釋,取0.1ml 涂布2216E 平板,28 ℃倒置培養(yǎng)2d 后進(jìn)行活菌計數(shù)。分離純化2216E 平板上的單菌落,菌種保存于- 70℃冰箱中。

    1.3
    水體細(xì)菌分離和計數(shù)
    現(xiàn)場用無菌玻璃瓶采集水樣500ml 密封帶回實驗室,然后取1ml 進(jìn)行10 倍梯度稀釋,取01 1ml 涂布2216E 平板,28 ℃倒置培養(yǎng)2d 后進(jìn)行活菌計數(shù)。隨機挑取2216E 平板上各種單菌落劃線作進(jìn)一步純化。菌種保存于- 70 ℃冰箱中。

    1.4 Biolg
    方法鑒定分析純菌株
    按照Biolog( ML3 _ 420) 快速鑒定系統(tǒng)操作程序,對純菌株進(jìn)行革蘭氏染色后將革蘭氏陰性細(xì)菌按照傳統(tǒng)方法[3] 進(jìn)行氧化酶生化鑒定和三糖鐵試驗,對其進(jìn)行分類。革蘭氏陽性菌按照Shewan 的海洋異養(yǎng)細(xì)菌檢索表檢索[4]。各類不同的革蘭氏陰性菌培養(yǎng)于Biolog 培養(yǎng)基,根據(jù)不同的濁度要求制備菌懸液,用多孔加樣器接種于96GN 微板,每孔150μL,置于合適培養(yǎng)溫度下培4h、16h 后觀察結(jié)果。根據(jù)微板純細(xì)菌代謝指紋情況和Biolog數(shù)據(jù)庫相似度以及位距,得出鑒定結(jié)果(1)。相似度在0.500-1.000之間,位距在0-5.00 之間,是比較滿意的結(jié)果。

    1.5
    細(xì)菌多樣性的分析
    根據(jù)生態(tài)學(xué)原理,按種的水平分析對蝦腸道細(xì)菌區(qū)系(P) 和水體細(xì)菌區(qū)系(W) 的多樣性,分別用Shannon-Wiener 多樣性指數(shù)( H ) 、豐度( D) 和均勻度( J ) [4] 表示。計算公式如下:
    H = -Pi log2 P 1
    D = ( S - 1) / log2N
    J = H / log2S
    式中Pi i 種的個數(shù)與樣品中總個數(shù)的比值,S為采樣點中樣品的總種類數(shù),N 為樣品中細(xì)菌的總數(shù)。

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    發(fā)表于 2012-8-30 16:04:22 |只看該作者
    2 結(jié)
    2.1 鑒定結(jié)果
    純化菌株鑒定結(jié)果見表1。從對蝦腸道菌群和水體細(xì)菌區(qū)系中共分離出71 株細(xì)菌,其中7 株革蘭氏陰性菌因為不在Biolog系統(tǒng)數(shù)據(jù)庫中或者是因為在移種、保種過程中死亡而沒有結(jié)果。對蝦腸道菌群主要由弧菌、希瓦氏菌屬、嗜氫菌屬、伯克霍爾德氏菌、氣單胞菌、食酸菌和芽孢桿菌組成。水體細(xì)菌區(qū)系主要包括弧菌、希瓦氏菌屬、艾肯菌、無色桿菌和芽孢桿菌。

    2.2
    細(xì)菌計數(shù)結(jié)果以及優(yōu)勢種組成
    對蝦腸道菌群和水體細(xì)菌區(qū)系的異養(yǎng)細(xì)菌總數(shù)以及優(yōu)勢種組成見表2。

    2.3
    細(xì)菌聚類分析
    對蝦腸道革蘭氏陰性菌和水體革蘭氏陰性菌在24h 記錄的對95種碳源利用的OD 值作為統(tǒng)計標(biāo)量,利用Biolog系統(tǒng)的Mlclust 程序進(jìn)行聚類分析。結(jié)果表明,對蝦腸道菌群與水體細(xì)菌區(qū)系菌株之間的相似性達(dá)到70% 以上,兩者優(yōu)勢菌的相似度高達(dá)90%以上(1) 。

    2.4
    細(xì)菌多樣性
    把未鑒定出來的菌株當(dāng)成一個類群后,分析了對蝦腸道菌群和水體細(xì)菌區(qū)系的細(xì)菌多樣性指數(shù)(3) 。

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    已有研究結(jié)果表明,對蝦的腸道菌群組成受外部環(huán)境影響較大,但弧菌是其腸道常見細(xì)菌。Moriaty[ 6] 發(fā)現(xiàn)在Penaeus japonicus 的養(yǎng)殖水體和腸道中具有相同的細(xì)菌類群。Yasuda [7] 報道,在日本對蝦的蚤狀幼體期弧菌是優(yōu)勢菌屬,養(yǎng)殖126d 以后蝦池中的優(yōu)勢菌是弧菌,但是在沉積物中假單胞菌是優(yōu)勢菌,而日本對蝦的成蝦棲息在沉積物中,因此認(rèn)為在日本對蝦成蝦消化道中的優(yōu)勢菌是假單胞菌。Dempsey[8] 報道了在對蝦Penaeus aztecus Penaeus setiferus 的胃和后腸中分離鑒定出5 類占優(yōu)勢的細(xì)菌類群,它們是弧菌、產(chǎn)堿桿菌、氣單胞菌、色桿菌和類假單胞菌( 假單胞菌、黃單胞菌和交替單胞菌) Wang [9]報道了野生健康中國對蝦腸道細(xì)菌區(qū)系優(yōu)勢菌屬為弧菌和發(fā)光桿菌屬。從本實驗結(jié)果看,蝦腸道和養(yǎng)殖水體具有相同的優(yōu)勢菌(2) ; 從細(xì)菌組成看,蝦腸道可培養(yǎng)的細(xì)菌種類比養(yǎng)殖水體多,對蝦腸道中存在部分細(xì)菌種類而養(yǎng)殖水體沒有(1) 。這表明對蝦腸道菌群與養(yǎng)殖水體有關(guān),也與飼料有關(guān)。在外部環(huán)境中少量存在的細(xì)菌進(jìn)入對蝦腸道后可以大量繁殖。

    在養(yǎng)殖環(huán)境中微生物主要充當(dāng)“消費者”的角色,起著分解動植物殘體、儲存轉(zhuǎn)化養(yǎng)分、降解污染物等作用,從而使得水域環(huán)境得到凈化; 但有害細(xì)菌的增長會導(dǎo)致病害的發(fā)生。通常條件致病菌是海水中的常見菌,有可能隨海水進(jìn)入養(yǎng)殖池中。在人工高密度養(yǎng)殖過程中各種人為因素如水處理過程( 化學(xué)試劑和UV 處理) 會干擾水體中的正常細(xì)菌區(qū)系,加上高密度的養(yǎng)殖、死亡動物以及活餌料的投喂造成高負(fù)荷的有機環(huán)境,促使池中有害細(xì)菌大量生長繁殖;【粓蟮朗菍ξr的條件致病菌[10] 。

    從碳源利用量來看,弧菌可以利用的碳源多達(dá)44種,一旦蝦池環(huán)境受到污染,弧菌就能優(yōu)先利用有機物而進(jìn)行增殖,若弧菌的增長抑制了其他細(xì)菌的生長,整個微生態(tài)平衡受到脅迫,生態(tài)功能下降甚至喪失,其蝦池物質(zhì)循環(huán)受到抑制。同時,當(dāng)水體中弧菌占據(jù)最大優(yōu)勢時對蝦腸道中也應(yīng)該存在大量弧菌,對蝦受到弧菌的攻擊,生長受到抑制、免疫力低下[11],再加上外部環(huán)境的脅迫就容易發(fā)病甚至死亡?梢病害的發(fā)生不是特定病原菌引起的,而是環(huán)境污染、對蝦抵抗力弱、微生態(tài)多樣性減少的綜合結(jié)果。本試驗中弧菌數(shù)量較多并占據(jù)優(yōu)勢地位,但是其細(xì)菌多樣性指數(shù)也較高,同時芽孢桿菌的存在可能以某種機制刺激了對蝦的免疫機能[12]防御弧菌病原菌的攻擊,因此并沒有爆發(fā)病害。

    從碳源利用量來看,對蝦腸道細(xì)菌在純培養(yǎng)時具有較大的碳源代謝能力。這可能表明對蝦腸道中的細(xì)菌區(qū)系與高等陸生動物腸道中細(xì)菌區(qū)系一樣參與了機體的消化過程,它們在對蝦的腸道中能夠以高密度存在,并且在相對短但營養(yǎng)豐富的腸道中具有非常大的消化活性。Wang [9] 研究也表明,對蝦腸道中某些弧菌很可能具有潛在的助消化能力。

    在全封閉式養(yǎng)殖模式下,水體細(xì)菌區(qū)系相對來說與殘餌的關(guān)系更為密切。在本研究中,整個對蝦腸道中弧菌和芽孢桿菌是優(yōu)勢菌,與水體中的優(yōu)勢菌組成一致。對蝦腸道菌群受水體以及餌料的影響較大;【▽ξr條件致病菌,不僅是蝦池水體中的正常菌群,還可以在對蝦腸道中大量繁殖,可能具有潛在的助消化能力?梢赃M(jìn)一步研究從弧菌中篩選有益菌再混合其他有益菌制成一個多功能群的微小區(qū)系應(yīng)用于水產(chǎn)養(yǎng)殖中,利用弧菌的適合蝦池環(huán)境生長的有利條件來進(jìn)行微生態(tài)調(diào)節(jié),化有害為有利,從而達(dá)到改善整個養(yǎng)殖生態(tài)環(huán)境的效果。

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